Родился 21 августа 1916 года в селе Шептаки (ныне Новгород-Северский район Черниговской области Украины). 19 августа 1935 года добровольно вступил в ряды Красной Армии. Окончил 11-ю военную авиационную школу лётчиков (город Ворошиловград). Служил в строевых частях ВВС.

С 22 июня 1941 года лейтенант П. Н. Вернигор на фронтах Великой Отечественной войны в составе 28-го ИАП (15-я САД, ВВС Юго-Западного фронта), летал на МиГ-3. 21 августа 1941 года был легко ранен в голову. С ноября 1941 года воевал в 736-м ИАП (6-й ИАК Московской зоны ПВО), где летал на "Харрикейне". В июле 1942 года заместитель командира эскадрильи старший лейтенант П. Н. Вернигор был сбит в воздушном бою, объявлен пропавшим без вести. Позднее вернулся в полк и продолжил боевую работу.

К октябрю 1943 года помощник командира по воздушно-стрелковой службе 736-го истребительного авиационного полка (317-я истребительная авиационная дивизия, 1-я Воздушная Истребительная армия ПВО, Особая Московская армия ПВО) капитан П. Н. Вернигор совершил 164 боевых вылета, в 20 воздушных боях сбил лично 5 и в составе пары 1 самолёт противника. 1 октября 1943 года полк был исключён из действующей армии. 24 декабря 1944 года передан в состав войск Центрального фронта ПВО.

После окончания войны продолжал служить в ВВС. С 15 сентября 1960 года подполковник П. Н. Вернигор - в запасе.

Награждён орденами: Красного Знамени (08.07.1941, 22.02.1955, 30.12.1956), Отечественной войны 1-й степени (31.08.1944, 11.03.1985), Красной Звезды (15.11.1950, 29.04.1954); медалями, в том числе "За боевые заслуги" (06.11.1945).