Родился в 1921 году в селе Аранчи (ныне село Суворово, Бахчисарайского района Республики Крым). Окончил среднюю школу. С января 1941 года в рядах Красной Армии, призван Железнодорожным РВК (города Москвы). В 1942 году окончил Армавирскую военную авиационную школу пилотов.

С 7 апреля 1943 года старший сержант Н. И. Халилов в действующей армии: в составе 291-го ИАП (265-я ИАД). Летал на Як-1.

25 мая 1943 года пилот 2-й эскадрильи 291-го истребительного авиационного полка (265-я истребительная авиационная дивизия, 3-й истребительный авиационный корпус, 4-я Воздушная армия, Северо-Кавказский фронт) младший лейтенант Н. И. Халилов не вернулся с боевого задания, числится пропавшим без вести. К тому времени в воздушных боях сбил лично 7 самолётов противника.

Награждён орденом Красного Знамени (09.05.1943) и медалью "За отвагу" (01.05.1943).