Родился 28 октября 1915 года на хуторе (ныне село Весёлая Победа, Ростовская область). В 1931 году окончил 7 классов сельской школы, в 1933 году - школу фабрично-заводского ученичества (ФЗУ) Ростовского завода "Сельмаш", в 1934 году - 8-й класс вечерней школы при этом же заводе. С марта 1931 года по июль 1935 года работал на заводе "Сельмаш" токарем. С 22 августа 1935 года в рядах Красной Армии, по ноябрь 1937 года учился в 7-й Сталинградской военной школе лётчиков. В звании лейтенанта служил младшим лётчиком в Киевском военном округе: до марта 1938 года - в 36-й ИАЭ (56-я ИАБ), до мая 1938 года - в 28-м ИАП.

Участник гражданской войны в Испании с 10 июня по 15 октября 1938 года. Был пилотом истребителя И-16, совершил 2 боевых вылета, участвовал в 2 воздушных боях, лично сбил истребитель противника. 23 июля 1938 года был легко ранен в левую руку и левую ногу во время воздушного боя над Валенсией, сел на повреждённом самолёте на ближайшем аэродроме. После лечения в госпитале, отправлен в СССР. 31 декабря 1938 года присвоено воинское звание "старший лейтенант".

Вернувшись в СССР, продолжал службу в Киевском военном округе. С октября 1938 года по июль 1939 года - начальник химической службы эскадрильи 28-го ИАП. Затем, до августа 1940 года, командовал 94-м отдельным звеном связи. С 15 сентября по 15 октября 1939 года участвовал в походе войск Красной Армии в Западную Украину и Западную Белоруссию. С августа 1940 года - заместитель командира эскадрильи и штурман эскадрильи 12-го ИАП.

С 22 июня 1941 года старший лейтенант Ф. В. Филипченко на фронтах Великой Отечественной войны в составе 12-го ИАП, летал на И-16. С июня по август 1942 года командовал эскадрильей в 13-м ИАП, летал на ЛаГГ-3. 19 сентября 1942 года за аварию самолёта приговорён к 5 годам лишения свободы, наказание заменено направлением в отдельную штрафную авиационную эскадрилью при 296-м ИАП (268-й ИАД). Будучи там командиром эскадрильи, по декабрь 1942 года выполнил 37 боевых вылетов на Як-1 и лично сбил 2 самолёта противника, искупив вину. Затем, до апреля 1943 года, командовал эскадрильей в 73-м Гвардейском ИАП, где продолжал летать на Як-1. К 6 февраля 1943 года выполнил 164 боевых вылета, в 64 воздушных боях сбил 5 самолётов противника лично и 4 в составе группы (по данным наградного листа имел 6 личных и 3 групповые победы). Сражался на Юго-Западном, Южном, Сталинградском фронтах. 25 марта 1943 года присвоено воинское звание "капитан".

С апреля по июль 1943 года служил в Московском военном округе, командовал эскадрильей 22-го ЗАП (3-я запасная авиационная бригада). Затем был назначен командиром звена в 1-ю КПАД ГВФ, и до конца войны в составе 20-го и 5-го ПАП перегонял американские самолёты по ленд-лизу с Аляски в Якутск. Лично перегнал 223 самолёта. Участник Советско-Японской войны в августе 1945 года.

С декабря 1945 служил в Южной группе войск (Венгрия). 31 октября 1946 года присвоено воинское звание "майор". С декабря 1950 года по ноябрь 1951 года - слушатель Липецких Высших офицерских лётно-тактических курсов. Затем продолжал службу в авиации ПВО. 23 декабря 1950 года присвоено воинское звание "подполковник", а 18 октября 1958 года - "полковник". С 30 сентября 1960 года - в отставке. Жил в Ростове-на-Дону. Умер 24 апреля 1992 года.

Награждён орденами: Красного Знамени (23.02.1939, 25.03.1943, 09.03.1956, 30.12.1956), Отечественной войны 1-й степени (14.09.1945, 11.03.1985), Отечественной войны 2-й степени, Красной Звезды; медалями "За оборону Сталинграда" (22.12.1942), "За победу над Германией" (09.05.1945), "За победу над Японией" (1945), "За боевые заслуги" (06.11.1945), "30 лет Советской Армии и Флота" (22.02.1948).