Родился в 1916 году в деревне Исаково (Ханинский район Тульской области). С 1937 года в рядах Красной Армии. Окончил военную авиационную школу лётчиков.

С 5 октября 1943 года лейтенант С. А. Филатов на фронтах Великой Отечественной войны в должности командира звена 69-го Гвардейского ИАП. Летал на "Аэрокобре". Воевал на 2-м Украинском и 1-м Украинском фронтах. 21 октября 1943 года подбит в бою, получил тяжёлое осколочное ранение, ожоги лица и рук.

К маю 1945 года заместитель командира эскадрильи, он же штурман эскадрильи 69-го Гвардейского истребительного авиационного полка (23-я Гвардейская истребительная авиационная дивизия, 6-й Гвардейский истребительный авиационный корпус, 2-я Воздушная армия, 1-й Украинский фронт) Гвардии старший лейтенант С. А. Филатов совершил около 150 боевых вылетов, провёл около 30 воздушных боёв, в которых сбил лично 13 самолётов противника.

После окончания войны продолжал служить в ВВС, командовал эскадрильей. В запас вышел в звании Гвардии майора.

Награждён орденами Красного Знамени (25.09.1944, 12.05.1945), Красной Звезды (28.11.1943); медалями.

Список известных воздушных побед С. А. Филатова:

Д а т а	Противник	Место падения самолёта или проведения воздушного боя	Свой самолёт
07.10.1943	1  ФВ-190	западнее Бородаевка	"Аэрокобра"
19.10.1943	1  Ме-109	Попельнастое
20.10.1943	1  Хе-111	севернее Жёлтое
21.10.1943	1  Хе-111	южнее Комиссаровка
28.04.1944	1  Ю-87	северо-восточнее Яссы
02.05.1944	1  Ю-87	южнее Думбрэвица
	1  Ю-87	северо-западнее Думбрэвица
04.08.1944	1  ФВ-190	Смердыня
15.03.1945	1  ФВ-190	севернее аэродром Ламсдорф
06.04.1945	2  Ме-109	аэродром Швейдниц
11.04.1945	1  ФВ-190	Бреслау
22.04.1945	1  ФВ-190	северо-западнее Герлиц
Всего сбитых самолётов - 13 + 0;  боевых вылетов - около 150;  воздушных боёв - около 30.

Из фотоматериалов военных лет: