Родился 22 марта 1913 года в городе Ленинграде (ныне Санкт-Петербург). Окончил 7 классов и техникум. Работал на судостроительном заводе. С 1935 года в рядах Красной Армии, призван Кировским РВК города Ленинграда. В 1939 году окончил Энгельсское военное авиационное училище лётчиков. Участник похода войск Красной Армии в Западную Украину (1939 год).

С 22 июня 1941 года старший лейтенант Н. И. Магерин на фронтах Великой Отечественной войны в должности командира эскадрильи 46-го ИАП (18 марта 1943 года преобразован в 68-й Гвардейский ИАП). Летал на И-153, ЛаГГ-3, "Харрикейне", "Киттихауке" и "Аэрокобре". Летом 1943 года Гвардии майор Н. И. Магерин был уже штурманом полка, а 7 ноября 1943 года принял командование полком. Сражался на Юго-Западном, Северном (Ленинградском), Западном, Сталинградском, Северо-Западном, Брянском, 1-м Прибалтийском, 3-м Белорусском фронтах. Трижды ранен в боях.

К маю 1945 года командир 68-го Гвардейского Клайпедского ордена Кутузова истребительного авиационного полка (5-я Гвардейская истребительная авиационная дивизия, 11-й истребительный авиационный корпус, 15-я Воздушная армия, Ленинградский фронт) Гвардии подполковник Н. И. Магерин совершил около 258 боевых вылетов, провёл 67 воздушных боёв, в которых сбил лично 10 и в составе группы 3 самолёта противниик.

До конца 1945 года продолжал командовать полком. В 1947-1951 гг. служил на Сахалине, Камчатке и Курильских островах. В 1952 году окончил Академические курсы. С 1953 года - командир отдельной авиационной дивизии. В 1958 году присвоено воинское звание "генерал-майор авиации". В 1960 году демобилизован по состоянию здоровья. В 1962-1973 гг. работал в Аэрофлоте начальником Ленинградского главного районного диспетчерского пункта. Умер в 2007 году. Похоронен в Санкт-Петербурге на Никольском кладбище Александро-Невской лавры.

Награждён орденами: Красного Знамени (пять, в том числе: 12.12.1942, 23.02.1943, 25.02.1943, 11.04.1945), Александра Невского (11.10.1943), Отечественной войны 1-й степени (03.09.1944, 11.03.1985), Красной Звезды (трижды, в том числе: 1942); медалями.

Список известных воздушных побед Н. И. Магерина:

Д а т а	Противник	Место падения самолёта или проведения воздушного боя	Свой самолёт
21.08.1941	1  Ме-109	Горелово	ЛаГГ-3
03.11.1941	1  Ю-88  (в паре)	Ситомля
01.12.1941	1  Ю-88  (в паре)	Фишево
02.07.1942	1  Ю-88  (в гр. 1/3)	восточнее Волоконовка	"Харрикейн"
20.02.1943	2  Ю-87	Бяково	"Киттихаук"
29.08.1943	1  ФВ-190	северо-западнее Тулебля	"Аэрокобра"
07.10.1943	1  ФВ-190	восточнее озеро Езерище *
09.10.1943	1  Ю-87	западнее Невель *
10.10.1943	1  Хе-111	северо-западнее озеро Пса *
	1  Ю-88	озеро Сидорово *
28.08.1944	1  ФВ-190	Салдус
14.09.1944	1  ФВ-190	юго-западнее Румбула
Всего сбитых самолётов - 10 + 3;  боевых вылетов - 258;  воздушных боёв - 67.

* Победа одержана в составе 28-го Гвардейского ИАП (куда был прикомандирован с группой лётчиков из 68-го Гвардейского ИАП)

Этапы большого пути: