Родился 6 июля 1915 года в посёлке Лагутенко (Суражский район Брянской области). В 1930 году окончил 7 классов Суражской средней школы. Поступил на работу на местное торфопредприятие, где трудился рабочим. С сентября 1932 по февраль 1934 года учился в Ленинградском строительном техникуме. Оставив учёбу на 2-м курсе, работал на заводе "Судмех", а с июня 1936 и до конца 1937 года - электромонтёром на заводе "Ленинская "Искра", одновременно учится в Приморском аэроклубе в Ленинграде. С 27 декабря 1937 года в рядах Красной Армии. В 1939 году окончил Борисоглебскую военную авиационную школу пилотов. Служил в составе 46-го ИАП (ВВС Киевского Особого военного округа). Участник похода Советских войск в Западную Украину в сентябре 1939 года.

С 22 июня 1941 года лейтенант И. Н. Лагутенко в действующей армии: в составе 46-го ИАП (14-я САП, Юго-Западный фронт), летал на И-16. С августа по сентябрь 1941 года сражался в 157-м ИАП (7-й ИАК ПВО, Ленинградский фронт), летал на И-16 и ЛаГГ-3. Затем вернулся в 46-й ИАП (21 марта 1943 года преобразован в 68-й Гвардейский ИАП), где летал ещё на "Харрикейне", "Киттихауке" и "Аэрокобре". В октябре-ноябре 1943 года был прикомандирован с группой лётчиков в состав 28-го Гвардейского ИАП. Сражался на Северо-Западном, 1-м Прибалтийском, 2-м Прибалтийском и 3-м Прибалтийском фронтах.

К 9 мая 1945 года заместитель командира 68-го Гвардейского истребительного авиационного полка по воздушно-стрелковой службе (5-я Гвардейская истребительная авиационная дивизия, 11-й истребительный авиационный корпус, 3-я Воздушная армия, 3-й Белорусский фронт) Гвардии майор И. Н. Лагутенко совершил около 350 боевых вылетов, провёл 83 воздушных боя, сбил лично 14 и в составе группы 6 самолётов противника. Указом Президиума Верховного Совета СССР от 18 августа 1945 года удостоен звания Героя Советского Союза с вручением ордена Ленина и медали "Золотая Звезда".

После войны продолжал службу в ВВС. Окончил Военно-Воздушную академию. С 6 ноября 1951 года Гвардии майор И. Н. Лагутенко - в запасе. Жил и работал в городе Щёлково (Московская область). Умер 8 июля 1956 года. В посёлке Лесное (Суражский район) установлен памятник, его именем названа школа.

Награждён орденами: Ленина (18.08.1945), Красного Знамени (23.02.1943, 03.09.1943, 11.10.1943, 06.11.1944), Александра Невского (06.05.1945), Отечественной войны 1-й степени (17.10.1942); медалями, в том числе "За боевые заслуги" (24.06.1948).