Родился 31 января (13 февраля) 1918 года в Москве. В 1932 году окончил 8 классов средней школы, в 1934 году - школу фабрично-заводского ученичества (ФЗУ). Работал электромонтёром на железной дороге. 16 декабря 1937 года добровольно вступил в ряды Красной Армии. В 1938 году окончил Борисоглебскую военную авиационную школу пилотов и был оставлен в ней лётчиком-инструктором.

С февраля 1942 года лейтенант В. С. Комаров в действующей армии. Служил в авиации ПВО. До марта 1944 года воевал в составе 630-го ИАП (9 октября 1943 года преобразован в 147-й Гвардейский ИАП). Был командиром эскадрильи, заместителем командира полка. Летал на И-16, ЛаГГ-3, американском "Киттихауке" и Ла-5.

К сентябрю 1943 года заместитель командира 630-го истребительного авиационного полка (106-я истребительная авиационная дивизия ПВО территории страны) майор В. С. Комаров совершил 209 боевых вылетов, провёл 26 воздушных боёв, сбил лично 10 и в составе группы 3 самолёта противника. Указом Президиума Верховного Совета СССР от 9 октября 1943 года удостоен звания Героя Советского Союза с вручением ордена Ленина и медали "Золотая Звезда" (№ 1126).

В конце марта 1944 года назначен командиром 145-го Гвардейского истребительного авиационного полка ПВО (106-я ИАД, Северный фронт ПВО и Западный фронт ПВО), где летал на Ла-5. До конца войны выполнил около 300 боевых вылетов, но воздушных побед больше не одерживал. Всю войну воевал в составе ПВО территории страны; прикрывал важные объекты втылах Калининского, Северо-Западного, Волховского, Ленинградского и 2-го Прибалтийского фронтов. Участвовал в обороне и снятии блокады Ленинграда, освобождении Прибалтики и блокаде Курляндской группировки противника.

После окончания войны продолжал командовать полком (в Прибалтике). 9 сентября 1945 года Гвардии подполковник В. С. Комаров погиб в автомобильной катастрофе. Похоронен на кладбище Райниса в городе Рига (Латвия).

Награждён орденами: Ленина (09.10.1943); Красного Знамени (19.11.1942, 05.09.1943); медалями.