Родился 11 мая 1917 года в селе Лузинское (ныне Москаленского района Омской области). Окончил сельскую школу. С 25 октября 1939 года в рядах Красной Армии, призван Омским ГВК. Окончил военную авиационную школу лётчиков. Служил в Канской ВАШ СБ (Красноярский край, город Канск), с началом Великой Отечественной войны - в 20-м ЗИАП Сибирского военного округа. В начале 1944 года был направлен в 483-й ИАП, который в Харьковском военном округе проходил переформирование и осваивал истребители Як-9Т и Як-9Д.

С 16 марта 1944 года лейтенант В. И. Исмагамбетов действующей армии: в должности командира звена 483-го ИАП. Боевую работу начал на 2-м Белорусском фронте (в составе 336-й ИАД, 6-й Воздушной армии), с 24 апреля 1944 года воевал на 1-м Белорусском фронте (в составе 16-й Воздушной армии), со 2 сентября 1944 года - уже на 3-м Прибалтийском фронте (в составе 14-й Воздушной армии). Летал на Як-9.

22 сентября 1944 года командир звена 483-го истребительного авиационного полка (336-я истребительная авиационная дивизия, 14-я Воздушная армия, 3-й Прибалтийский фронт) старший лейтенант В. И. Исмагамбетов не вернулся с боевого задания, был учтён как пропавший без вести. Позднее нашёлся (обстоятельства не установлены). Всего совершил около 70 боевых вылетов, провёл более 20 воздушных боёв и сбил лично 7 самолётов противника.

После окончания войны продолжал служить в ВВС. С 14 декабря 1948 года старший лейтенант В. И. Исмагамбетов - в запасе. Умер 27 декабря 2008 года.

Награждён орденами: Красного Знамени (23.07.1944), Отечественной войны 1-й степени (01.09.1944), Отечественной войны 2-й степени (11.03.1985); медалью "За победу над Германией в Великой Отечественной войне 1941-1945 гг." (09.05.1945).