Родился 27 марта 1920 года в селе Преображенка (Ореховский район Запорожской области Украины). В 1937 году окончил 8 классов средней школы. С 1939 года в рядах Военно-Морского Флота. В 1942 году окончил военную авиационную школу лётчиков и был направлен в состав ВВС Краснознамённого Балтийского Флота.

С августа 1942 года сержант И. Н. Емельяненко на фронтах Великой Отечественной войны в должности пилота 3-й эскадрильи 4-го Гвардейского ИАП КБФ. Летал на И-16. 30 сентября 1942 года был ранен в воздушном бою. С ноября 1942 года воевал в 21-м ИАП КБФ. Летал на И-16, Як-7 и Як-9.

17 августа 1944 года командир звена 2-й эскадрильи 21-го истребительного авиационного полка (8-я минно-торпедная авиационная дивизия, ВВС Краснознамённого Балтийского Флота) старший лейтенант И. Н. Емельяненко над городом Паланга вступил в бой с истребителями противника. Израсходовав все боеприпасы, тараном сбил ФВ-190. Сам благополучно посадил повреждённый самолёт на аэродроме.

К 9 мая 1945 года совершил 415 боевых вылетов, провёл 47 воздушных боёв, в которых сбил лично 12 и в составе группы ещё 12 самолётов противника. Дважды был ранен.

После окончания войны служил в составе ВВС Черноморского Флота. 3 января 1957 года переведён в войска ПВО. С 29 июня 1958 года подполковник И. Н. Емельяненко - в запасе (по болезни).

Награждён орденами: Ленина (15.05.1946), Красного Знамени (19.01.1943, 10.04.1944, 18.07.1944, 22.09.1944), Отечественной войны 1-й степени (19.07.1945, 11.03.1985), Красной Звезды (03.11.1953); медалями, в том числе "За боевые заслуги" (02.06.1951).