Родился 2 мая 1922 года в городе Кременчуг (Полтавская область Украины). С июня 1940 года в рядах Красной Армии, окончил военную авиационную школу лётчиков. Служил в составе 272-го ИАП (Северо-Кавказский военный округ), затем прошёл переподготовку в 8-м ЗИАП (Приволжский военный округ).

С марта 1942 года сержант В. С. Бойченко на фронтах Великой Отечественной войны в должности пилота 66-го ИАП (202-я и 216-я ИАД), летал на Як-7 и Як-1. С февраля по июнь 1943 года воевал в составе 42-го Гвардейского ИАП (216-я САД), продолжая летать на Як-1. С октября 1943 года - снова в 66-м ИАП (239-я ИАД), где летал на "Аэрокобре". Сражался на Западном, Закавказском, Северо-Кавказском и 2-м Белорусском фронтах.

К 9 мая 1945 года старший лётчик 66-го истребительного авиационного полка (329-я истребительная авиационная дивизия, 4-я Воздушная армия, 2-й Белорусский фронт) лейтенант В. С. Бойченко совершил 72 боевых вылета, в 17 воздушных боях сбил лично 8 и в составе пары 3 самолёта противника (в последнем наградном листе указывается на 6 личных и 2 групповые победы).

После окончания войны продолжал служить в ВВС. С 12 декабря 1955 года капитан В. С. Бойченко - в запасе.

Награждён орденами: Отечественной войны 1-й степени (17.12.1943, 11.03.1985), Красной Звезды (05.11.1942, 19.06.1945, 30.12.1956), Славы 3-й степени (17.12.1943); медалями, в том числе "За боевые заслуги" (15.11.1950).